复旦大学附属中山医院是卫生部部属综合性教学医院。医院开业于1937年，是当时中国人管理的第一所大型综合性医院，隶属于国立上海医学院，为纪念中国民主革命的先驱孙中山先生而命名为孙中山纪念医院，后更名为中山医院。解放后曾称上海第一医学院附属中山医院和上海医科大学附属中山医院，2001年用现名。
经过70多年的发展，中山医院本部目前占地面积95892.1㎡，总建筑面积185736.27㎡，核定床位1700张。2010年门急诊就诊量263万人次，出院病人6.9万人次，住院手术病人4.5万人次。全院职工2986人，拥有中国工程院院士2人，高级职称375人，医师956人，护士1165人，医技人员239人。
院本部设有除小儿科以外的所有科室、综合实力雄厚。心脏、肝癌、肾脏和肺部疾病诊治是医院的重点和特色，诊治水平始终处于国内领先地位。其中心血管病和肝肿瘤是上海市临床医学中心。消化科、检验科和麻醉科是国家临床重点学科。上海市心血管病研究所、复旦大学肝癌研究所、上海市影像医学研究所、上海市中西医结合康复研究所、复旦大学呼吸病研究所、复旦大学血管外科研究所、复旦大学普通外科研究所、复旦大学内镜诊疗研究所、复旦大学核医学研究所设在院内，成为医院重要的研究机构。上海市的院内感染、超声诊断、呼吸内科、心血管内科、胸心外科、普通外科6个临床质量控制中心也挂靠中山医院。医院每年承担国家、卫生部和上海市重大科研项目近百项。近年获国家级、教育部、卫生部和上海市科技成果奖百项。设有博士点15个，硕士点21个，有卫生部专科医师培训基地22个，上海市住院医师培训基地26个。每年举办国家级继续医学教育学习班40期，招收进修医生600名，为国家培养了许多高级医学人才。
医院拥有先进的医疗设备，包括断层放射治疗系统(Tomo Therapy)、PET-CT、320排640层超速螺旋CT、全数字平板式心血管造影机(DSA)、直线加速器、3.0T磁共振断层扫描仪、达芬奇机器人手术系统、单光子发射计算机断层扫描仪(SPECT)、数字化X线成像系统(DR)、重症监护系统和远程医疗教学系统等等。
核医学科由荣独山教授于1958年组建，系我国重要的核医学临床、科研、教学和药理基地，其总体医疗和科研水平在国内于领先地位。
1958年中山医院成立同位素实验室
1959年建立放射医学教研组、放射医学研究所
1964年编辑出版了中国第一本专著“临床同位素学”
1978年受卫生部委托承办了临床核医学医师进修班
1978年作为第一批硕士点，开始招收硕士研究生
1979年批准成立核医学研究所
1990年通过评审确定为博士点
1991年定名为核医学科
